为进一步发挥我国园林植物资源的优势和特点，展示植物景观建设和管理水平，促进和提升公园景观与环境建设，中国公园协会自2012年9月起，开展了首届“中国公园年度最佳植物专类园区”评选活动。中国科学院武汉植物园沉水植物专类园在此次评选活动中脱颖而出，与北京市植物园海棠园、上海市植物园盆景园等16家植物专类园区共同被评选为“中国公园2012—2013年度最佳植物专类园区”。
武汉植物园沉水植物区建于2003年，占地面积约2000平方米，该区根据沉水植物的不同生存生境修建了142个养护池和32个水族箱，搜集全世界珍稀沉水植物品种56种，是国内第一个集物种保育和科普展示为一体的沉水植物展示区。